Кафедра организации и управления транспортными процессами образована в 2015 году в результате объединения кафедры экономики и управления на предприятии (образована в 1997 году) и кафедры экономики и управления на предприятиях транспорта (образована в 1996 году). В 2018 году переименована в кафедру автомобильного транспорта.

Заведующей кафедры является Ткачева Яна Сергеевна, кандидат экономических наук, доцент. Научные разработки Ткачевой Я.С. отражены в 86 опубликованных научных и учебно-методических работах, в том числе 3 учебных пособия, 1 монографию, 15 публикаций в журналах, рекомендованных ВАК и 3 статьи базы данных WebofScience, Scopus. За высокий профессионализм, образцовое выполнение своих должностных обязанностей и значительный вклад в развитие университета Ткачева Я.С. дважды награждена Почетной грамотой МГТУ (2011, 2014). За значительный вклад в подготовку и проведение XXII Олимпийских зимних игр и XI Паралимпийских зимних игр 2014 года в г. Сочи Ткачева Я.С. награждена памятной медалью «XXII Олимпийские зимние игры и XI Паралимпийские зимние игры 2014 года в г. Сочи» и грамотой за подписью Президента Российской Федерации В.В. Путина.

На кафедре ведется подготовка магистров по направлению подготовки 23.04.01 Технология транспортных процессов (магистерская программа: «Логистика на транспорте»), бакалавров по направлениям подготовки 23.03.01 Технология транспортных процессов (профили подготовки: «Логистика на транспорте», «Организация перевозок на автомобильном транспорте»), 23.03.03 Эксплуатация транспортно-технологических машин и комплексов (профиль «Автомобильный сервис»).

Руководителем магистерской программы является доктор экономических наук, профессор Гукетлев Юсуф Хаджибирамович.

Научные разработки Гукетлева Ю.Х. отражены в более 80 научных публикациях. Тема диссертации на соискание ученой степени доктора экономических наук: «Формирование систем регулирования региональных транспортных комплексов». Гукетлев Ю.Х. избран членом-корреспондентом Академии наук социальных технологий и местного самоуправления. Награжден знаком «Почетный автотранспортник» Министерства транспорт РФ и почетной грамотой Министерства образования и науки РФ. За активную научно-практическую деятельность и подготовку высококвалифицированных  специалистов  для транспортной отрасли  Республики Адыгея присвоено почетное звание «Заслуженный деятель науки Республики Адыгея».

В целях повышения качества подготовки бакалавров по направлению подготовки «Технология транспортных процессов» кафедра принимает активное участие в региональных и всероссийских смотрах-конкурсах выпускных квалификационных работ в г. Пятигорске и г. Ростов-на-Дону с предварительным отбором работ комиссией выпускающей кафедры. Сегодня около 80% от общего числа выпускных квалификационных работ проходят первый (внутривузовский) и второй (региональный) этапы конкурсной эстафеты, лучшие работы участвуют в III туре (заключительный этап) Всероссийского смотра-конкурса выпускных квалификационных работ (дипломных проектов). По итогам регионального и заключительного этапов смотра-конкурса около 20 работ отмечены дипломами I и II степени.

В рамках государственной программы развития и поддержки науки в Республике Адыгея кафедрой разрабатываются инновационные темы: 

1. Синергетический подход в управлении транспортной логистики и транспортного комплекса и его влияние на региональную экономику.

2. Инновационный  подход в управлении и организации предприятий сервиса и технического обслуживания автомобилей и его влияние на региональную транспортную отрасль в современных условиях

Благодаря активной работе кафедры МГТУ является членом Международной ассоциации автотранспортного и дорожного образования (МААДО).

Кафедрой налажено сотрудничество с автотранспортными предприятиями города, организуются круглые столы с участием руководителей автотранспортных предприятий, сотрудников кафедры и студентов по проблемам развития транспорта.